La perle d’eau douce est produite dans un mollusque d’eau douce (lac, rivière), le plus souvent dans une moule mais il peut s’agir également d’une huître perlière évoluant en eau douce. La perle est formée grâce au processus de défense que le mollusque met en place, suite à l’entrée d’un grain de sable ou d’un parasite dans sa cavité, habituellement entre la coquille et la surface externe du manteau de l’huître. La surface externe est la seule partie du mollusque qui peut produire de la nacre. Le corps étranger va être alors enveloppé dans un petit sac nommé sac perlier fait de cellules productrices de nacre.